Trái đất tương lai ngập nước, Natsuki Ikaruga – chàng trai mất mẹ và chân trong tai nạn – quay về quê nhà chìm nửa dưới biển sau thời gian vật lộn ở thành phố. Mang nợ từ bà nội – nhà hải dương học, hắn lặn xuống tiệm đồ cũ ngập nước cùng Catherine – người đòi nợ lạ mặt, và phát hiện Atri – cô robot giống người thật. Với ý chí không gục ngã, Natsuki cùng Atri sửa chữa cuộc sống ở thị trấn sắp biến mất, khám phá kế hoạch Eden của bà nội. Từ những ngày hè giản dị, họ dần hiểu nhau, đối mặt nỗi đau để tìm lối thoát cho thế giới đang chìm.
